Указом Президента Казахстана 25 февраля 1993 года Агентство космических исследований Казахской ССР было преобразовано в Национальное Аэрокосмическое Агентство Республики Казахстан(НАКА РК)
Сразу же по решению первого Генерального директора НАКА РК Токтара Аубакирова на космодроме «Байконур» было создано управление Национального Аэрокосмического Агентства Казахстана под руководством Меирбека Молдабекова.
В течение этих 13 лет статус главного космического ведомства республики менялся не раз, но свое летоисчисление нынешний Аэрокосмический комитет Министерства образования и науки РК (АКК МОН РК) ведет именно с февраля 1993 года, когда на космодроме «Байконур» начало свою работу управление НАКА РК.
Сегодня в байконырском управлении Аэрокосмического комитета работает 15 человек. По словам начальника управления Еркина Шаймагамбетова, кроме основных направлений, таких как контроль за условиями эксплуатации арендованных объектов космодрома «Байконур», координация работ по Договору аренды, контроль за ввозом и вывозом имущества космодрома, сейчас перед коллективом стоят новые задачи по развитию наземной космической инфраструктуры на базе космодрома «Байконур» и подготовке предложений к реализации конкретных космических проектов и программ в интересах Республики Казахстан.